Санкт-Петербургский научный институт физической культуры был создан в январе 1933 года на базе Государственного института физического образования имени П.Ф.Лесгафта.
Изначально Институт располагался на проспекте Динамо дом 2 (с 1933 по 2008 г.).
16 мая 2021 года сотрудниками сектора физиологии спорта и сектора подготовки научно-педагогических кадров, переподготовки и повышения квалификации организован и успешно проведен международный вебинар «СПОРТИВНАЯ ТРАНСФОРМАЦИЯ» с участием 85 тренеров и специалистов спортивных команд из России, Италии, Кипра, Эстонии.
28–30 апреля, в Москве в Гостином дворе состоялось конгрессно-выставочное мероприятие «SportForumLive. Современный спорт. Инновации и перспективы». Мероприятие проводилось Министерством спорта Российской Федерации под эгидой Международного спортивного форума «Россия – спортивная держава».
24 апреля 2021 года зав. сектором комплексных компьютерных технологий Короткова Анна Константиновна выступила на Международной научно-практической конференции «Инновационные подходы в области физической культуры и спорта» с докладом «Применение инновационных технологий в паралимпийском спорте».
В рамках научного сотрудничества с ФГБОУ ВО «ЧГИФК» сотрудники сектора современных технологий подготовки высококвалифицированных спортсменов СПбНИИФК Новикова Н.Б. и Захаров Г.Г. приняли участие во II Международной научно-практической конференции «Спорт и спортивная медицина».
3-4 февраля 2021 года в Центральной Олимпийской академии г. Москва состоялась XXXII Олимпийская научная сессия молодых ученых и студентов России "Олимпизм, олимпийское движение, Олимпийские игры: история и современность", посвященная памяти первого Президента Олимпийской академии Урала Л.М. Куликова.
4 и 5 декабря 2020 г. ФГБУ СПбНИИФК выступил партнером в проведении Международной научно-практической онлайн-конференции «СПОРТИВНАЯ ПСИХОЛОГИЯ В МЕЖКУЛЬТУРНОМ ПРОСТРАНСТВЕ», организованной на базе Федерального государственного автономного учреждения высшего образования «Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н. Ельцина».
С 29 по 31 октября в НГУ им. П.Ф.Лесгафта проходил международный научный конгресс «Двадцатипятилетний путь развития адаптивной физической культуры», посвященный 25-летию кафедры теории и методики адаптивной физической культуры Университета.
15-16 октября 2020 года на базе Федерального государственного бюджетного учреждения «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт физической культуры» прошла Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Спортивное движение: опыт, проблемы, развитие».
В период с 28 сентября по 7 октября 2020 года в Сочи прошла V Всероссийская научно-практическая конференция и курсы повышения квалификации тренеров по лыжным гонкам, организованные на базе Российского международного олимпийского университета в городе Сочи при поддержке Олимпийского комитета России и Федерации лыжных гонок России.
В соответствии с Постановлением Президиума ЦИК СССР от 27 июля 1932 года на базе Государственного института физического образования (ГИФО) им. П.Ф. Лесгафта в январе 1933 года был создан Научный институт им. П.Ф. Лесгафта, впоследствии - Ленинградский научно-исследовательский институт физической культуры (ЛНИИФК).
Первоначально Институт располагался на проспекте Динамо дом 2 (с 1933 по 2008 г.)
